Mayroong dalawang mapagkukunan para sa mga puti-asul-pula na kulay ng bandila ng Slovenian. Para sa pambansang pang-etnikong banner na si Slovenia ay nagpatibay ng isang kopya ng bandila ng Russia, upang ipakita ang pagkakaisa sa mga kapwa Slavic na tao, sa oras ng Napoleonic Wars. Kahit na mas maaga pa, gayunpaman, ang Banal na emperador ng Roma ay nagbigay ng isang coat ng arm sa "Crown Land of Carniola," na noon ay bahagi ng emperyo. Itong coat ng arm na ito ay nagtatampok ng isang puting kalasag na may dalang asul na agila na may isang pulang-puti at checkered crescent sa dibdib nito. Ang isa pang mahalagang amerikana sa kasaysayan ng Slovenia ay ang ginamit ng county ng Celje - isang asul na kalasag na may tatlong dilaw na bituin. Sa wakas, sa ilalim ng rehimeng komunista ng ika-20 siglo, ang amerikana ng mga braso ng Slovenia ay may asul at puti na kulot na mga linya ng pahalang upang iminumungkahi ang Adriatic baybayin ng bansa, pati na rin ang isang naka-istilong tatlong puting bundok - ang pinakamataas na Slovenia, ang sikat na Triglav.
Ipinahayag ng Slovenia ang kalayaan nito noong Hunyo 25, 1991, ngunit kailangang lumaban sa hukbo ng Yugoslav upang maitaguyod ang soberanya. Ang watawat na nakataas sa Araw ng Kalayaan ay ang tradisyonal na puti-asul-pula na pan-Slavic tricolor. Upang makilala ito mula sa mga katulad na mga watawat ng Russia at Slovakia, ang bagong amerikana ng mga braso ng Slovenia ay idinagdag sa itaas na sulok ng hoist na nagpapatong sa mga puti at asul na guhitan. Nagtatampok ang kalasag na iyon ng isang kumbinasyon ng Triglav at mga kulot na guhitan ng mga komunista na armas na may dilaw na bituin sa isang asul na background mula sa kalasag ng Celje.
