Noong 1980s at '90s, ang Sistine Chapel ay sumailalim sa isang mahaba at detalyadong pamamaraan ng pagpapanumbalik na na-sponsor ng isang korporasyon sa telebisyon ng Hapon at isinasagawa ng mga nangungunang eksperto ng Italyano at internasyonal. Inalis ng paglilinis ang maraming siglo ng dungis, alikabok, at usok ng kandila mula sa mga fresco at ipinahayag sa hindi inaasahang makikinang na mga kulay na bahagyang sumasalungat sa bantog na mga katangian ng sculptural ng obra maestra ni Michelangelo. Isang matinding kontrobersya — na kinasasangkutan ng maraming mga restorer, art historians, at mga dalubhasa sa mga kaugnay na larangan - napapalibutan ang proyekto mula sa simula pa lamang. Ang debate ay nakasentro sa isang pangunahing isyu: si Michelangelo, sa paraan ng mga pintor ng fresco ng araw, ay nagbago ang kanyang natapos na fresco na may pintura ng secco (tuyo) matapos ang plaster ay natuyo? (Karaniwang ginawa ito ng mga pintura ng Fresco bilang isang paraan ng pagwawasto ng mga pagkakamali, pagpino ng kanilang mga gawa, at pag-aaplay ng mga pigment na hindi maaaring magpaubaya sa pakikipag-ugnay sa tubig.) At kung gayon, ay tinanggal ang mga restorer ng bawat layer hanggang sa pinahiran na plaster ? Sa kasong ito, ang anino, pagwawasto, at mga pandikit na tinanggal ng mga restorer ay lumilitaw na ang resulta ng mga nakaraang mga kampanya sa pagpapanumbalik. Habang ang kontrobersyal na pagpapanumbalik ng Sistine Chapel ay napapag-usapan pa rin, ang mga art conservator ay hindi na iniisip na isang isyu.
