Ang pagbabagong-anyo ng molekular na istraktura

Ang pagbabagong-anyo, anuman sa alinman sa walang katapusan na bilang ng mga posibleng spatial na pag-aayos ng mga atoms sa isang molekula na resulta mula sa pag-ikot ng mga nasasakupang grupo ng mga atom tungkol sa solong mga bono.

protina: Pagbabago ng mga protina sa mga interface

Tulad ng maraming iba pang mga sangkap na may parehong mga pangkat na hydrophilic at hydrophobic, ang mga natutunaw na protina ay may posibilidad na lumipat sa interface sa pagitan ng hangin

Iba't ibang mga conformations ay posible para sa anumang molekula kung saan ang isang solong covalent bond ay nagkokonekta sa dalawang polyatomic na grupo, sa bawat isa na hindi bababa sa isang atom ay hindi nagsisinungaling kasama ang axis ng solong bono na pinag-uusapan. Ang pinakasimpleng tulad ng molekula ay ng hydrogen peroxide, kung saan ang dalawang pangkat ng hydroxyl ay maaaring iikot nang may paggalang sa isa't isa tungkol sa axis ng bond na oxygen-oxygen. Ang pagkakaroon ng higit sa isang solong bono sa isang molekula - tulad ng propane (CH ₃ ―CH ₂ ―CH ₃), halimbawa - nagdaragdag lamang sa pagiging kumplikado ng sitwasyon nang hindi binabago ang likas na katangian. Sa mga molekula tulad ng mga cyanogen (N≡C "C≡N) o butadiyne (H" C≡C "C≡C" - H), ang lahat ng mga atomo ay namamalagi kasama ang axis ng gitnang solong bono, upang walang makilala umiiral.

Sa pangkalahatan, ang bawat nakikilala pagkakaiba-iba ng isang molekula ay kumakatawan sa isang estado ng iba't ibang mga potensyal na enerhiya dahil sa pagpapatakbo ng kaakit-akit o nagtatakip na mga puwersa na nag-iiba sa mga distansya sa pagitan ng iba't ibang mga bahagi ng istraktura. Kung wala ang mga puwersa na ito, ang lahat ng mga pagsasaayos ay magkakaroon ng parehong enerhiya, at ang pag-ikot tungkol sa iisang bono ay magiging ganap na libre o hindi mapigilan. Kung ang mga puwersa ay malakas, magkakaiba-iba ang pagkakaiba-iba ng enerhiya o katatagan: ang molekula ay karaniwang sumasakop sa isang matatag na estado (isa sa mababang enerhiya) at sumasailalim ng paglipat sa ibang matatag na estado lamang sa pagsipsip ng sapat na enerhiya upang maabot at dumaan sa hindi matatag na intervening pagbabagong loob.

Ang mga puwersa ng intramolecular sa ethane, halimbawa, ay mahina na ang pagkakaroon ng kanilang pag-iral ay maaaring ibawas lamang mula sa mga banayad na epekto sa mga thermodynamic na katangian tulad ng enthalpy at entropy. (Kahit na ang panloob na pag-ikot sa ethane ay mahigpit na pinaghihigpitan, ang tatlong pinaka-matatag na pagsasaayos na ito ay hindi naiintindihan.) Ang mga molekular na istruktura ng ilang mas kumplikadong mga compound, gayunpaman, ay nagpapataw ng gayong malakas na hadlang sa pag-ikot na mga stereoisomeric form - naiiba lamang sa pagsasaayos - ay matatag na sapat upang ihiwalay