Mga sistemang Taxonomic
Ang Taxonomy, ang agham ng pag-uuri ng mga organismo, ay batay sa phylogeny. Ang mga unang sistema ng taxonomic ay walang teoretikal na batayan; Ang mga organismo ay pinagsama ayon sa maliwanag na pagkakapareho. Mula nang mailathala noong 1859 ng Charles Darwin's On the Origin of Spies by Means of Natural Selection, gayunpaman, ang taxonomy ay batay sa natanggap na mga panukala ng paglaki at relasyon ng ebolusyon.
Ang data at konklusyon ng phylogeny ay malinaw na nagpapakita na ang puno ng buhay ay produkto ng isang makasaysayang proseso ng ebolusyon at ang mga antas ng pagkakahawig sa loob at sa pagitan ng mga pangkat ay tumutugma sa mga antas ng relasyon sa pamamagitan ng paglusong mula sa karaniwang mga ninuno. Ang isang ganap na binuo phylogeny ay mahalaga para sa pag-iisip ng isang taxonomy na sumasalamin sa mga likas na ugnayan sa loob ng mundo ng mga buhay na bagay.
Katibayan para sa mga tiyak na phylogenies
Ang mga biologist na nag-post ng phylogenies ay nakukuha ang kanilang pinaka-kapaki-pakinabang na katibayan mula sa larangan ng paleontology, comparative anatomy, comparative embryology, at molekular genetics. Ang mga pag-aaral ng molekular na istraktura ng mga gen at ng pamamahagi ng heograpiya ng flora at fauna ay kapaki-pakinabang din. Ang rekord ng fossil ay madalas na ginagamit upang matukoy ang phylogeny ng mga pangkat na naglalaman ng mga matigas na bahagi ng katawan; ginagamit din ito hanggang sa mga oras ng magkakaibang mga species ng mga phylogenies na itinayo batay sa ebidensya ng molekular.
Karamihan sa mga data na ginamit sa paggawa ng mga paghatol ng phylogenetic ay nagmula sa paghahambing na anatomy at mula sa embryology, bagaman ang mga ito ay mabilis na nalampasan ng mga sistemang itinayo gamit ang data ng molekular. Sa paghahambing ng mga tampok na karaniwang sa iba't ibang mga species, sinusubukan ng mga anatomist na makilala ang pagitan ng mga homologies, o pagkakapareho na minana mula sa isang karaniwang ninuno, at mga pagkakatulad, o pagkakatulad na lumitaw bilang tugon sa magkatulad na gawi at mga kondisyon ng pamumuhay.
Ang mga pagsusuri sa biochemical na isinagawa sa huling kalahati ng ika-20 at ang unang bahagi ng ika-21 siglo ay nag-ambag ng mahalagang data sa mga pag-aaral ng phylogenetic. Sa pamamagitan ng pagbibilang ng mga pagkakaiba-iba sa pagkakasunud-sunod ng mga yunit na bumubuo ng mga molekula ng protina at deoxyribonucleic acid (DNA), ang mga mananaliksik ay gumawa ng isang tool para sa pagsukat ng degree kung saan ang iba't ibang mga species ay lumilihis mula noong umuusbong mula sa isang karaniwang ninuno. Dahil ang mitochondrial DNA ay may napakataas na rate ng mutation kumpara sa nuclear DNA, kapaki-pakinabang ito para sa pagtaguyod ng mga ugnayan sa mga grupo na na-diverge kamakailan. Mahalaga, ang aplikasyon ng molekulang genetika sa mga sistematikong ay katulad ng paggamit ng radioisotopes sa geologic dating: nagbabago ang mga molekula sa iba't ibang mga rate, kasama ang ilan, tulad ng mitochondrial DNA, mabilis na umuusbong at iba pa, tulad ng ribosomal RNA, mabagal na umuusbong. Ang isang mahalagang palagay pagkatapos sa paggamit ng mga molekula para sa muling pagbuo ng phylogeny ay piliin ang naaangkop na gene para sa edad ng taxon sa ilalim ng pag-aaral.
